FH-Prof. Mag. Dr. Alexandra Graf
Deputy Head of Degree Programs Bioengineering; Academic Staff
alexandra.graf@fh-campuswien.ac.at
+43 1 606 68 77-3602
+43 1 606 68 77-3609
Room: E.3.27
Favoritenstraße 222
1100 Wien
Lectures
Applied Life Sciences
berufsbegleitend, SS2024 more
Betreuung Bachelorarbeit 1 - BIF ILV
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Lecture contents
Die Lehrveranstaltung dient der Betreuung der schriftlichen Verfassung der Bachelorarbeit. Es wird der biologische Hintergrund des gewählten Themas aufgearbeitet und die Form der schriftlichen Arbeit besprochen.
Assessment methods
Abschlusspräsentation
Teaching methods
Vortrag, Diskussionen
Language
Deutsch
berufsbegleitend, WS2023/24 more
Bioinformatik VO
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Lecture contents
Bearbeiten von kurzen angewandten Beispielen aus der Bioinformatik.
Assessment methods
Praktische Übungen
Teaching methods
Vorlesung (Powerpointpräsentation)
praktische Übungen am Computer
Language
Deutsch
berufsbegleitend, WS2023/24 more
Bioinformatische Datenanalyse (Statistik) UE
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Markus Weisse
Lecture contents
Einführung in die Programmierung mit R und die Analyse von biologischen Datensätzen:
R Themen:
- Grundlagen
- Installation von Paketen
- Datentypen
- Kontrollstrukturen
- Funktionen
- Plots
- Shiny
Assessment methods
Beispiele in DataCamp und über Moodle
Teaching methods
Vorlesung und Übungen. Zugang zu DataCamp.
Language
Deutsch-Englisch
berufsbegleitend, SS2024 more
Molekularbiologie VO
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Ing. DI (FH) Dr. Harald Kühnel, MSc
Lecture contents
Geschichtlicher Zusammenhang
Genom, Transkriptom und Proteom
Unterschiede zwischen Eukaryoten, Prokaryoten, Archaea und Viren.
Replikation - Transkription - Translation
Mutationen und Rekombination
Struktur der DNA; DNA-Basen; DNA-Basen-Veränderungen; DNA Schaden und Reparatur
weitere Methoden der DNA Analytik
Sequenziertechnologie
Agarose Gel Elektrophorese
DNA Extraktionen
Nucleinsäure Quantifizierung
PCR / qPCR
Micro Arrays
FISH
Blotting Techniken
Transfektion, Transduktion (Methoden)
Genom Editing (CRISPR, Zn Finger, …)
Plasmide Komponenten Aufbau…
Expressions Wirte
Zelllinienentwicklung
Praktische Beispiele
Primerdesign, Massenberechnungen analytischer Restriktionsverdauung
Assessment methods
Endprüfung
Endprüfung
Teaching methods
Vorlesung; es werden auch praktische Fähigkeiten wie Primerdesign und ähnliches vermittelt.
Language
Deutsch
berufsbegleitend, SS2024 more
Programmierung und Bioinformatik ILV
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Lecture contents
Einführung in die Anwendungsfelder der Bioinformatik, es werden einzelne Themengebiete aufgegriffen und diskutiert und Analysen praktisch durchgeführt. Grundkonzepte von Programmiersprachen werden besprochen und in praktischen Beispielen erarbeitet.
Assessment methods
Immanente Leistungsüberprüfung
Fallbearbeitung und MC-Test
Teaching methods
Vorlesung/Vortrag, Diskussion und problembasiertes Lernen
Language
Deutsch
berufsbegleitend, SS2024 more
Programmkonzeption, Programmierung, Automatisierung, Bachelorarbeit 1 SE
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Mag. Alexander Hirner, Bakk., Prof. Mag. rer. nat. Karl Rumbold, PhD, Monika Waldherr, MSc
Lecture contents
Die Vorlesung dient zur Betreuung der Bachelorarbeit, die Inhalte richten sich nach dem ausgewählten Thema.
Python (Norbert Auer):
Es werden aufbauend auf den bisherigen Lehrveranstaltungen sämtliche wesentlichen Mechanismen der Programmierung in Python vorgestellt und anhand von praktischen Beispielen geübt, wie Funktionen, Klassenhierarchien, Polymorphismus, Exceptions, Module, und Dateiein/ausgabe.
Assessment methods
Diesese Vorlesung dient als Grundlage für die auszuführende Bachelor-Arbeit und wird zusammen mit dieser beurteilt.
Teaching methods
Vortrag & Dialog,
Interaktives Arbeiten,
Übungen am Notebook
Language
Deutsch
berufsbegleitend, SS2024 more
Ausgewählte Themen der Bioinformatik SE
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, DI (FH) Anton Grünberg
Lecture contents
Das Seminar soll den Studierenden einen Überblick über die unterschiedlichen Bereiche der Bioinformatik geben. Es werden Vortragende aus verschiedenen Arbeitsfeldern und Themengebieten eingeladen, die über ihre Erfahrungen und Projekte sprechen.
Assessment methods
Schriftliche Prüfung am Ende der Veranstaltung.
Teaching methods
Seminarreihe
Vorträge und Diskussionen
Language
Deutsch-Englisch
berufsbegleitend, SS2024 more
Masterarbeitsseminar SE
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Lecture contents
Im Seminar stellt jeder Studierende das Thema seiner Masterarbeit vor, und die Fortschritte und Herausforderungen während dem Verlauf der Masterarbeit. Mit den anderen Studierenden und der Lektorin werden Lösungsansätze und Literaturreferenzen diskutiert.
Assessment methods
Präsentation
Teaching methods
Vorträge, Diskussion
Language
Deutsch
berufsbegleitend, WS2023/24 more
Metagenomanalyse ILV
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Lecture contents
Einführung in die Erzeugung und Analyse von Metagenom/Mikrobiom Daten.
Assessment methods
Praktisches Beispiel, Präsentation
Teaching methods
Vortrag, Diskussion und praktische Beispiele.
Language
Deutsch-Englisch
berufsbegleitend, WS2023/24 more
Transcriptomics und Genomics ILV
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Lecture contents
1) Erarbeiten ausgewaehlter Kapitel der Bioinformatik (Short/long-read Technologien, spezielle Anwendungen z.B. ChIP-Seq, RNA-Seq) und
2) Theoretische Grundlagen und Anwendung entsprechender bioinformatischer Programme zur Analyse der Daten
Assessment methods
40 % Praktisch: Abgabe von praktischen programmier Beispielen
20 % Theoretisch:Moodle Zwischenprüfung
40 % Journal Club: Präsentation eines wissenschaftlichen Artikels in der Gruppe
Teaching methods
- Einleitungen und Erklärungen (Vortrag)
- Gemeinsame Übungen am Computer
Language
Deutsch
berufsbegleitend, WS2023/24 more
Transcriptomics und Genomics Übung UE
Lector: Lukas Fürnwein, BSc, FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Lecture contents
Die Übung dient zur Festigung des in der Vorlesung Transcriptomics and Genomics erworbenem Wissen. Es werden Programmierbeispiele in Python und R, und Bash durchgeführt und mit Software zur Sequenzanalyse gearbeitet.
Assessment methods
Practical examples, DataCamp courses
Teaching methods
DataCamp, Moodle, Linux Server, und Beispielskripte
Language
Deutsch
berufsbegleitend, SS2024 more
Vorbereitung auf die Masterarbeit SE
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Lecture contents
Form und Merkmale der schriftlichen Darlegung der Masterarbeit (Diplomarbeit). Erarbeitung und Präsentation (Technik und Übung) ausgewählter Themen der Bioinformatik.
Assessment methods
-
Teaching methods
Vortrag - Diskussion
Language
Deutsch-Englisch
Vollzeit, WS2023/24 more
Bioinformatik ILV
Lector: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Elias Lehner
Lecture contents
In der Einführung wird besprochen was Bioinformatik ist und warum man heute Bioinformatik braucht. Die Studierenden werden in die Grundlagen der Programmierung eingeführt und können kleine Beispiele selbst ausprobieren.
Es werden einzelne Themengebiete aufgegriffen und die bioinformatische Anwendungen durch diskutiert, die Themengebiete umfassen:
- Warum hat sich Bioinformatik entwickelt, was ist Bioinformatik
- Human Genome Projekt und seine Konsequenzen
- Biologische Sequenzen, Sequenzvergleich und Datenbanksuche
- Mustersuche
- Sequenzstruktur und Strukturvorhersage
- High Throughput Technologien und Datenanalyse
Programmieren:
- Praktische Beispiele in R und eine kurze Einführung in Python
Assessment methods
Abgabe der Übungen bzw. multiple choice Tests zu den Übungen im Moodle. Kurzer Test über die Theorie in Moodle.
Teaching methods
Vorlesung, Powerpoint Präsentation, Diskussion und selbständiges ausprobieren von Bioinformatik Tools und kleinen Programmen
Language
Deutsch-Englisch