Personendetails

FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

Forschung und Entwicklung


T: +43 1 606 68 77-3602
F: +43 1 606 68 77-3609

Raum: MUT.02
Muthgasse 11/2
1190 Wien

Persönlicher Webspace


Lehrveranstaltungen 2021/22

Applied Life Sciences

> Transcriptomics und Genomics ILV
Bioinformatik more

Transcriptomics und Genomics ILV

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Eric Schinogl, BSc

2SWS
4ECTS

Lehrinhalte

1) Erarbeiten ausgewaehlter Kapitel der Bioinformatik (Next Generation Sequencing, ChIP-Seq, RNA-Seq) und
2) Anwendung entsprechender bioinformatischer Werkzeuge zur Analyse der assoziierten Daten
3) unter Verwendung von diverse script-Sprachen unter Linux (zBBash, AWK, Perl)

Prüfungsmodus

40 % Praktisch: Abgabe eines kurzen Programmes zur Lösung einer Aufgabe
60 % Theoretisch: Schriftliche Prüfung

Lehr- und Lernmethode

- Einleitungen und Erklärungen (Vortrag)
- Gemeinsame Übungen am Computer

Sprache

Deutsch

> Ausgewählte Themen der Bioinformatik SE
Bioinformatik more

Ausgewählte Themen der Bioinformatik SE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, DI (FH) Anton Grünberg

1SWS
2ECTS

Lehrinhalte

Das Seminar soll den Studierenden einen Überblick über die unterschiedlichen Bereiche der Bioinformatik geben. Es werden Vortragende aus verschiedenen Arbeitsfeldern und Themengebieten eingeladen, die über ihre Erfahrungen und Projekte sprechen.

Prüfungsmodus

Schriftliche Prüfung am Ende der Veranstaltung.

Lehr- und Lernmethode

Seminarreihe
Vorträge und Diskussionen

Sprache

Deutsch-Englisch

> Datenanalyse Labor LB
Bioinformatik more

Datenanalyse Labor LB

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Ing. DI (FH) Dr. Harald Kühnel, MSc, Katharina Seiberl, BSc MSc, Monika Waldherr, MSc

2SWS
4ECTS

Lehrinhalte

-) Einführung in die Oxford Nanopore Sequenziertechnologie
-) Durchführung einer DNA Sequenzierung mittels MinION im Labor (Wet Lab)
-) Erarbeitung einer geeigneten Qualitätskontrolle
-) Erarbeitung einer geeigneten Analyse-Pipeline
-) Interpretation und Diskussion der Ergebnisse

Prüfungsmodus

Immanente Leistungsüberprüfung, Protokoll der Ergebnisse der Übung, Abschlussprüfung

Lehr- und Lernmethode

-) Vortrag
-) praktische Übungen im Wet-Lab und In-Silico

Sprache

Deutsch

> Vorbereitung auf die Masterarbeit SE
Bioinformatik more

Vorbereitung auf die Masterarbeit SE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

0.5SWS
1ECTS

Lehrinhalte

Form und Merkmale der schriftlichen Darlegung der Masterarbeit (Diplomarbeit). Erarbeitung und Präsentation (Technik und Übung) ausgewählter Themen der Bioinformatik.

Prüfungsmodus

-

Lehr- und Lernmethode

Vortrag - Diskussion

Sprache

Deutsch-Englisch

> Bioinformatik ILV
Molekulare Biotechnologie more

Bioinformatik ILV

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

3SWS
3ECTS

Lehrinhalte

In der Einführung wird besprochen was Bioinformatik ist und warum man heute Bioinformatik braucht. Die Studierenden werden in die Grundlagen der Programmierung eingeführt und können kleine Beispiele selbst ausprobieren.
Es werden einzelne Themengebiete aufgegriffen und die bioinformatische Anwendungen durch diskutiert, die Themengebiete umfassen:
- Warum hat sich Bioinformatik entwickelt, was ist Bioinformatik
- Human Genome Projekt und seine Konsequenzen
- Biologische Sequenzen, Sequenzvergleich und Datenbanksuche
- Mustersuche
- Sequenzstruktur und Strukturvorhersage
- High Throughput Technologien und Datenanalyse

Programmieren:
- Praktische Beispiele in R und eine kurze Einführung in Python

Prüfungsmodus

Abgabe der Übungen im Moodle sowie kurze multiple choice Tests im Moodle.

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung, Powerpoint Präsentation, Diskussion und selbständiges ausprobieren von Bioinformatik Tools und kleinen Programmen

Sprache

Deutsch-Englisch

> Biotechnologisches Seminar SE
Bioinformatik more

Biotechnologisches Seminar SE

Vortragende: Ing. Michael Geissler, MSc., FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, FH-Prof. DI Dr. Michael Maurer, Katharina Seiberl, BSc MSc

0.5SWS
1ECTS

Lehrinhalte

Als Beispiel aus der Biotechnologie werden die Studierenden im gärungstechnischen Labor an der Umsetzung eines Bierrezepts arbeiten. Die Studierenden bekommen eine Einführung in das Thema und können sich mit Automatisierungslösungen (Brew Pie - Rasberry Pie) und Datenerfassung praktisch auseinandersetzen. Zu den Tätigkeiten im Labor werden die Studierenden Labels für ihr Bier designen und eine Webseite erzeugen auf der die bearbeiteten Rezepte zu sehen sind.

Die Studierenden werden in Gruppen von 3-4 Personen arbeiten.

Prüfungsmodus

Die Mitarbeit im gärungstechnischen Labor sowie beim Design und der umsetzung der Webseite wird benotet.

Lehr- und Lernmethode

Vortrag, praktische Labor Übung

Sprache

Deutsch

> Metagenomanalyse ILV
Bioinformatik more

Metagenomanalyse ILV

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

1SWS
2ECTS

Lehrinhalte

Einführung in die Erzeugung und Analyse von Metagenom/Mikrobiom Daten.

Prüfungsmodus

Präsentation eines praktischen Beispiels.

Lehr- und Lernmethode

Vortrag, Diskussion und praktisches Beispiel.

Sprache

Deutsch-Englisch

> Masterabschlussprüfung AP
Bioinformatik more

Masterabschlussprüfung AP

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

0SWS
1ECTS

Lehrinhalte

Methologie zur Durchführung der DA:
Klärung der Vorgangsweise anhand einzelner Präsentationen der Arbeiten

Prüfungsmodus

Beurteilung der Präsentation

Lehr- und Lernmethode

Präsentationen

Sprache

Deutsch

> Masterarbeitsseminar SE
Bioinformatik more

Masterarbeitsseminar SE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

1SWS
1ECTS

Lehrinhalte

Im Seminar stellt jeder Studierende das Thema seiner Masterarbeit vor, und die Fortschritte und Herausforderungen während dem Verlauf der Masterarbeit. Mit den anderen Studierenden und der Lektorin werden Lösungsansätze und Literaturreferenzen diskutiert.

Prüfungsmodus

Präsentation

Lehr- und Lernmethode

Vorträge, Diskussion

Sprache

Deutsch

> Transcriptomics und Genomics Übung UE
Bioinformatik more

Transcriptomics und Genomics Übung UE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Eric Schinogl, BSc

1.5SWS
3ECTS

Lehrinhalte

Die Übung dient zur Festigung des in der Vorlesung Transcriptomics and Genomics erworbenem Wissen. Es werden Programmierbeispiele in Python und R, und Bash durchgeführt und mit Software zur Sequenzanalyse gearbeitet.

Prüfungsmodus

Practical examples

Lehr- und Lernmethode

Moodle, Linux Server, und Beispielskripte

Sprache

Deutsch

Publikationen

An der FH Campus Wien verfasste Publikationen von Alexandra Graf finden Sie in unserer Publikationsdatenbank, ebenso die betreuten Abschlussarbeiten. Alle anderen Publikationen sind im Personal Webspace angeführt.

Studiengänge

Bioengineering

Bachelorstudium, berufsbegleitend

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Bioinformatik

Masterstudium, berufsbegleitend

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Im Gespräch

7 Whatchado-Fragen an Alexandra Graf

"Den Curriculum planen, Lektoren aussuchen, die Inhalte der Vorlesungen planen", das ist nur ein Teilbereich von Alexandra Grafs Tätigkeit auf der FH Campus Wien, wo sie zur Forschung und Entwicklung Bioengineering beiträgt. Auch in der Bioinformatik ist sie nicht untätig: "Ich bekomm Daten von Gruppen, die in der Biotechnologie arbeiten, da geht’s z. B. darum DNA von Bakterien und Pilzen zu entschlüsseln."

FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Forschung und Entwicklung