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FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

Forschung und Entwicklung


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Lehrveranstaltungen 2018/19

Applied Life Sciences

> Ausgewählte Themen der Bioinformatik SE
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Ausgewählte Themen der Bioinformatik SE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, DI (FH) Anton Grünberg, DI Dr. nat. techn. Matthias Hackl

1 SWS
2 ECTS

Lehrinhalte

Das Seminar soll den Studierenden einen Überblick über die unterschiedlichen Bereiche der Bioinformatik geben. Es werden Vortragende aus verschiedenen Arbeitsfeldern und Themengebieten eingeladen, die über ihre Erfahrungen und Projekte sprechen.

Prüfungsmodus

Schriftliche Prüfung am Ende der Veranstaltung.

Lehr- und Lernmethode

Seminarreihe
Vorträge und Diskussionen

Sprache

Deutsch-Englisch

> Betreuung Bachelorarbeit 1 - BIF VO+UE
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Betreuung Bachelorarbeit 1 - BIF VO+UE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Anna Tomaselli, BSc

2 SWS
2 ECTS

Lehrinhalte

Die Lehrveranstaltung dient der Betreuung der schriftlichen Verfassung der Bachelorarbeit. Es wird der biologische Hintergrund des gewählten Themas aufgearbeitet und die Form der schriftlichen Arbeit besprochen.

Prüfungsmodus

Abschlusspräsentation

Lehr- und Lernmethode

Vortrag, Diskussionen

Sprache

Deutsch

> Bioinformatik VO
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Bioinformatik VO

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

0.5 SWS
1 ECTS

Lehrinhalte

Beispielhaft werden algorithmische Grundkonzepte in der Bioinformatik druchgesprochen und praktisch ausprobiert
- Umgang mit Sequenzen als Daten
- Erzeugung von phylogenetischen Bäumen
- Hidden Markov Modelle

Prüfungsmodus

Praktische Programmieraufgabe

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung (Powerpointpräsentation)
praktische Übungen am Computer

Sprache

Deutsch

> Molekulare Genetik und Stammentwicklung VO
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Molekulare Genetik und Stammentwicklung VO

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Mag.a Elisabeth Malle, PhD

2 SWS
4 ECTS

Lehrinhalte

Vermittlung der Grundlagen der Molekularen Genetik:

Woraus bestehen Lebewesen – biochemisch - aus welchen Molekülen - aus welchen Kompartimenten – Strukturen?
Wie werden diese Moleküle – Kompartimente – Strukturen an die Nachkommen weitergegeben?
Wie funktionieren Lebewesen auf chemisch-physikalischer Ebene?
Wie wird das Leben „gesteuert“?
Inwieweit sind die Nachkommen identisch, bzw. wie unterschieden sie sich von den Eltern?
Wie erklärt man genetische – biologische Verwandtschaft auf molekularer Ebene?

Vermittlung der Grundlagen der rekombinanten DNA-Technologie:

Enzymatische Modifikation der DNA
Vervielfältigung der DNA - Polymerase Chain Reaction (PCR)
Genexpression und DNA-Klonierung
Gentransfer in die Wirtszelle
Isolierung von genomischer und Plasmid-DNA
Bakteriophagen - Biologie und Applikation
Qualitative und quantitative analytische Methoden
Hybridisierung und Blotting Techniken
DNA-Rekombination und deren spezielle Anwendungen
Expressions-/Wirt-/Vektorsysteme
Genomics und Proteomics

Prüfungsmodus

schriftliche Prüfung

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung

Sprache

Deutsch

> Programmierung und Bioinformatik VO+UE
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Programmierung und Bioinformatik VO+UE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Anna Tomaselli, BSc

1 SWS
3.5 ECTS

Lehrinhalte

1. In der Einführung wird besprochen was Bioinformatik ist und warum man heute Bioinformatik braucht. Es werden einzelne Themengebiete aufgegriffen und die bioinformatische Anwendungen durchdiskutiert.
2. Es werden konzeptionelle Grundkonzepte von Programmiersprachen durchbesprochen und in kleinen praktischen Beispielen erarbeitet.

Die spezifischen Themengebiete der Bioinformatik umfassen:
- Warum hat sich Bioinformatik entwickelt, was ist Bioinformatik
- Human Genome Projekt und seine Konsequenzen
- Biologische Sequenzen, Sequenzvergleich und Datenbanksuche
- Mustersuche
- Sequenzstruktur und Strukturvorhersage
- High Throughput Technologien und Datenanalyse

Prüfungsmodus

Mitarbeit bei den Übungen, kurzer Test am Ende der Vorlesung

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung, Powerpoint Präsentation, Diskussion und selbständiges ausprobieren von Bioinformatik Tools

> Programmkonzeption, Programmierung, Automatisierun...
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Programmkonzeption, Programmierung, Automatisierung, Bachelorarbeit 1 SE

Vortragende: DI Norbert Auer, Dr. Matthias Gerstl, FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Anna Tomaselli, BSc

5 SWS
10 ECTS

Lehrinhalte

Die Vorlesung dient zur Betreuung der Bachelorarbeit, die Inhalte richten sich nach dem ausgewählten Thema.


Python (Norbert Auer):
Es werden aufbauend auf den bisherigen Lehrveranstaltungen sämtliche wesentlichen Mechanismen der Programmierung in Python vorgestellt und anhand von praktischen Beispielen geübt, wie Funktionen, Klassenhierarchien, Polymorphismus, Exceptions, Module, und Dateiein/ausgabe.

Prüfungsmodus

Diesese Vorlesung dient als Grundlage für die auszuführende Bachelor-Arbeit und wird zusammen mit dieser beurteilt.

Lehr- und Lernmethode

Vortrag & Dialog,
Interaktives Arbeiten,
Übungen am Notebook

Sprache

Deutsch

> Sequenzvergleich und Funktionsvorhersage VO
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Sequenzvergleich und Funktionsvorhersage VO

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

1 SWS
2 ECTS

Lehrinhalte

In der Lehrveranstaltung beschäftigen wir uns mit der Analyse von Sequenzen. Ausgehend von einer Genomsequenz werden wir versuchen zu einer funktionellen Annotation des Organismus zu gelangen. In diesem Prozess werden wir verschiedene bioinformatische Programme verwenden und eigene Skripts schreiben.

Prüfungsmodus

Die Note wird zu 30% aus der Mitarbeit und den Übungsbeispielen und zu 70% aus der Abschlussprüfung errechnet.

Lehr- und Lernmethode

Powerpoint Vortrag, selbständiges Erarbeiten von Beispielen am PC, Diskussionen.

Sprache

Deutsch

> Transcriptomics und Genomics ILV
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Transcriptomics und Genomics ILV

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Dr.rer.nat. Markus Jaritz, Anna Tomaselli, BSc

1.5 SWS
3 ECTS

Lehrinhalte

1) Erarbeiten ausgewaehlter Kapitel der Bioinformatik (Next Generation Sequencing, ChIP-Seq, RNA-Seq) und
2) Anwendung entsprechender bioinformatischer Werkzeuge zur Analyse der assoziierten Daten
3) unter Verwendung von diverse script-Sprachen unter Linux (zBBash, AWK, Perl)

Prüfungsmodus

40 % Praktisch: Abgabe eines kurzen Programmes zur Lösung einer Aufgabe
60 % Theoretisch: Schriftliche Prüfung

Lehr- und Lernmethode

- Einleitungen und Erklärungen (Vortrag)
- Gemeinsame Übungen am Computer

Sprache

Deutsch

> Vorbereitung auf die Masterarbeit SE
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Vorbereitung auf die Masterarbeit SE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

0.5 SWS
1 ECTS

Lehrinhalte

Form und Merkmale der schriftlichen Darlegung der Masterarbeit (Diplomarbeit). Erarbeitung und Präsentation (Technik und Übung) ausgewählter Themen der Bioinformatik.

Prüfungsmodus

-

Lehr- und Lernmethode

Vortrag - Diskussion

Sprache

Deutsch-Englisch

Publikationen

An der FH Campus Wien verfasste Publikationen von Alexandra Graf finden Sie in unserer Publikationsdatenbank, ebenso die betreuten Abschlussarbeiten. Alle anderen Publikationen sind im Personal Webspace angeführt.

Studiengänge

Bioengineering

Bachelor, berufsbegleitend

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Bioinformatik

Masterstudium, berufsbegleitend

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Im Gespräch

7 Whatchado-Fragen an Alexandra Graf

“Den Curriculum planen, Lektoren aussuchen, die Inhalte der Vorlesungen planen”, das ist nur ein Teilbereich von Alexandra Grafs Tätigkeit auf der FH Campus Wien, wo sie zur Forschung und Entwicklung Bioengineering beiträgt. Auch in der Bioinformatik ist sie nicht untätig: “Ich bekomm Daten von Gruppen, die in der Biotechnologie arbeiten, da geht’s z. B. darum DNA von Bakterien und Pilzen zu entschlüsseln.”

FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Forschung und Entwicklung