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FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

Forschung und Entwicklung


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Lehrveranstaltungen 2020/21

Applied Life Sciences

> Molekulare Genetik und Stammentwicklung VO
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Molekulare Genetik und Stammentwicklung VO

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Ing. DI (FH) Dr. Harald Kühnel, MSc

2SWS
4ECTS

Lehrinhalte

Vermittlung der Grundlagen der Molekularen Genetik:
Woraus bestehen Lebewesen - was ist ihr Erbmaterial - aus welchen Kompartimenten – Strukturen?
Wie werden diese Moleküle – Kompartimente – Strukturen an die Nachkommen weitergegeben?
Wie wird die Information aus dem Genom in den Zellen umgesetzt?
Wie sind die Prozesse „gesteuert“? Wodurch entstehen Unterschiede zwischen Arten oder Individuen?
Wie erklärt man genetische – biologische Verwandtschaft auf molekularer Ebene?

Grundlagen Teil Themen:
- Geschichtlicher Zusammenhang
- Genom, Transkriptom und Proteom
- Unterschiede zwischen Eukaryoten, Prokaryoten, Archaea und Viren.
- Replikation - Transkription - Translation
- Mutationen und Rekombination

Methoden die im Grundlagenteil behandelt werden:
- Sequenziertechnologie

Prüfungsmodus

schriftliche Prüfung

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung

Sprache

Deutsch

> Bioinformatik VO
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Bioinformatik VO

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

0.5SWS
1ECTS

Lehrinhalte

Einführung in die Arbeitsumgebung mit Linux, R und Python.
Einführung in das Arbeiten mit einer Serverumgebung und den Konzepten der Versionskontrolle mit Git.

Prüfungsmodus

Praktische Übungen

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung (Powerpointpräsentation)
praktische Übungen am Computer

Sprache

Deutsch

> Bioinformatische Datenanalyse (Statistik) UE
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Bioinformatische Datenanalyse (Statistik) UE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

1SWS
2ECTS

Lehrinhalte

Einführung in die Programmierung mit R und die Analyse von biologischen Datensätzen:

R Themen:
- Datentypen
- Kontrollstrukturen
- Funktionen
- Pakete
- Plots

Prüfungsmodus

Beispiele in DataCamp und über Moodle

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung und Übungen. Zugang zu DataCamp.

Sprache

Deutsch-Englisch

> Programmkonzeption, Programmierung, Automatisierun…
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Programmkonzeption, Programmierung, Automatisierung, Bachelorarbeit 1 SE

Vortragende: DI Norbert Auer, FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

5SWS
10ECTS

Lehrinhalte

Die Vorlesung dient zur Betreuung der Bachelorarbeit, die Inhalte richten sich nach dem ausgewählten Thema.


Python (Norbert Auer):
Es werden aufbauend auf den bisherigen Lehrveranstaltungen sämtliche wesentlichen Mechanismen der Programmierung in Python vorgestellt und anhand von praktischen Beispielen geübt, wie Funktionen, Klassenhierarchien, Polymorphismus, Exceptions, Module, und Dateiein/ausgabe.

Prüfungsmodus

Diesese Vorlesung dient als Grundlage für die auszuführende Bachelor-Arbeit und wird zusammen mit dieser beurteilt.

Lehr- und Lernmethode

Vortrag & Dialog,
Interaktives Arbeiten,
Übungen am Notebook

Sprache

Deutsch

> Transcriptomics und Genomics ILV
Bioinformatik more

Transcriptomics und Genomics ILV

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Lisa Tucek, BSc.

2SWS
4ECTS

Lehrinhalte

1) Erarbeiten ausgewaehlter Kapitel der Bioinformatik (Next Generation Sequencing, ChIP-Seq, RNA-Seq) und
2) Anwendung entsprechender bioinformatischer Werkzeuge zur Analyse der assoziierten Daten
3) unter Verwendung von diverse script-Sprachen unter Linux (zBBash, AWK, Perl)

Prüfungsmodus

40 % Praktisch: Abgabe eines kurzen Programmes zur Lösung einer Aufgabe
60 % Theoretisch: Schriftliche Prüfung

Lehr- und Lernmethode

- Einleitungen und Erklärungen (Vortrag)
- Gemeinsame Übungen am Computer

Sprache

Deutsch

> Ausgewählte Themen der Bioinformatik SE
Bioinformatik more

Ausgewählte Themen der Bioinformatik SE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, DI (FH) Anton Grünberg

1SWS
2ECTS

Lehrinhalte

Das Seminar soll den Studierenden einen Überblick über die unterschiedlichen Bereiche der Bioinformatik geben. Es werden Vortragende aus verschiedenen Arbeitsfeldern und Themengebieten eingeladen, die über ihre Erfahrungen und Projekte sprechen.

Prüfungsmodus

Schriftliche Prüfung am Ende der Veranstaltung.

Lehr- und Lernmethode

Seminarreihe
Vorträge und Diskussionen

Sprache

Deutsch-Englisch

> Datenanalyse Labor LB
Bioinformatik more

Datenanalyse Labor LB

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Ing. DI (FH) Dr. Harald Kühnel, MSc

2SWS
4ECTS

Lehrinhalte

Als Vorbereitung wird ein Oxford Nanopore Datensatz analysiert und eine Analyseabfolge erarbeitet. Im Labor (wet lab) wird DNA einer Probe extrahiert und eine Sequenzierung durchgeführt. Die erzeugten Daten werden mit der erarbeiteten Analysemethode analysiert und interpretiert.

Prüfungsmodus

Immanente Leistungsüberprüfung, Standard (Protokoll der Ergebnisse der Übung)

Lehr- und Lernmethode

Vortrag, praktische Übungen im wet-lab und in-silico

Sprache

Deutsch

> Vorbereitung auf die Masterarbeit SE
Bioinformatik more

Vorbereitung auf die Masterarbeit SE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

0.5SWS
1ECTS

Lehrinhalte

Form und Merkmale der schriftlichen Darlegung der Masterarbeit (Diplomarbeit). Erarbeitung und Präsentation (Technik und Übung) ausgewählter Themen der Bioinformatik.

Prüfungsmodus

-

Lehr- und Lernmethode

Vortrag - Diskussion

Sprache

Deutsch-Englisch

> Bioinformatik ILV
Molekulare Biotechnologie more

Bioinformatik ILV

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

3SWS
3ECTS

Lehrinhalte

In der Einführung wird besprochen was Bioinformatik ist und warum man heute Bioinformatik braucht. Die Studierenden werden in die Grundlagen der Programmierung eingeführt und können kleine Beispiele selbst ausprobieren.
Es werden einzelne Themengebiete aufgegriffen und die bioinformatische Anwendungen durch diskutiert, die Themengebiete umfassen:
- Warum hat sich Bioinformatik entwickelt, was ist Bioinformatik
- Human Genome Projekt und seine Konsequenzen
- Biologische Sequenzen, Sequenzvergleich und Datenbanksuche
- Mustersuche
- Sequenzstruktur und Strukturvorhersage
- High Throughput Technologien und Datenanalyse

Programmieren:
- Praktische Beispiele in R und eine kurze Einführung in Python

Prüfungsmodus

Abgabe der Übungen im Moodle sowie kurze multiple choice Tests im Moodle.

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung, Powerpoint Präsentation, Diskussion und selbständiges ausprobieren von Bioinformatik Tools und kleinen Programmen

Sprache

Deutsch-Englisch

> Programmierung und Bioinformatik VO+UE
Bioengineering more

Programmierung und Bioinformatik VO+UE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Lisa Tucek, BSc.

1SWS
3.5ECTS

Lehrinhalte

1. In der Einführung wird besprochen was Bioinformatik ist und warum man heute Bioinformatik braucht. Es werden einzelne Themengebiete aufgegriffen und die bioinformatische Anwendungen durchdiskutiert.
2. Es werden konzeptionelle Grundkonzepte von Programmiersprachen durchbesprochen und in kleinen praktischen Beispielen erarbeitet.

Die spezifischen Themengebiete der Bioinformatik umfassen:
- Warum hat sich Bioinformatik entwickelt, was ist Bioinformatik
- Human Genome Projekt und seine Konsequenzen
- Biologische Sequenzen, Sequenzvergleich und Datenbanksuche
- Mustersuche
- Sequenzstruktur und Strukturvorhersage
- High Throughput Technologien und Datenanalyse

Prüfungsmodus

Mitarbeit bei den Übungen, kurzer Test am Ende der Vorlesung

Lehr- und Lernmethode

Vorlesung, Powerpoint Präsentation, Diskussion und selbständiges ausprobieren von Bioinformatik Tools

> Betreuung Bachelorarbeit 1 - BIF VO+UE
Bioengineering more

Betreuung Bachelorarbeit 1 - BIF VO+UE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf

2SWS
2ECTS

Lehrinhalte

Die Lehrveranstaltung dient der Betreuung der schriftlichen Verfassung der Bachelorarbeit. Es wird der biologische Hintergrund des gewählten Themas aufgearbeitet und die Form der schriftlichen Arbeit besprochen.

Prüfungsmodus

Abschlusspräsentation

Lehr- und Lernmethode

Vortrag, Diskussionen

Sprache

Deutsch

> Transcriptomics und Genomics Übung UE
Bioinformatik more

Transcriptomics und Genomics Übung UE

Vortragende: FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf, Lisa Tucek, BSc.

1.5SWS
3ECTS

Lehrinhalte

Die Übung dient zur Festigung des in der Vorlesung Transcriptomics and Genomics erworbenem Wissen. Es werden Programmierbeispiele in Python und R, und Bash durchgeführt und mit Software zur Sequenzanalyse gearbeitet.

Prüfungsmodus

Practical examples

Lehr- und Lernmethode

Moodle, Linux Server, und Beispielskripte

Sprache

Deutsch

Publikationen

An der FH Campus Wien verfasste Publikationen von Alexandra Graf finden Sie in unserer Publikationsdatenbank, ebenso die betreuten Abschlussarbeiten. Alle anderen Publikationen sind im Personal Webspace angeführt.

Studiengänge

Bioengineering

Bachelor, berufsbegleitend

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Bioinformatik

Masterstudium, berufsbegleitend

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Im Gespräch

7 Whatchado-Fragen an Alexandra Graf

“Den Curriculum planen, Lektoren aussuchen, die Inhalte der Vorlesungen planen”, das ist nur ein Teilbereich von Alexandra Grafs Tätigkeit auf der FH Campus Wien, wo sie zur Forschung und Entwicklung Bioengineering beiträgt. Auch in der Bioinformatik ist sie nicht untätig: “Ich bekomm Daten von Gruppen, die in der Biotechnologie arbeiten, da geht’s z. B. darum DNA von Bakterien und Pilzen zu entschlüsseln.”

FH-Prof.in Mag.a Dr.in Alexandra Graf
Forschung und Entwicklung