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Die FH Campus Wien besteht aus Hochschulleitung, Departments mit den jeweiligen Studiengängen und Abteilungen. Zusätzlich sind Tocherunternehmen für Forschung und Entwicklung, Weiterbildung, Infrastruktur und Gastronomie etabliert.
Der Erhalter der FH Campus Wien ist als Verein organisiert. Zur Durchführung und Organisation des Lehr- und Prüfungsbetriebs wurde ein FH-Kollegium eingerichtet, an dessen Spitze die Rektorin/der Rektor steht.